MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanomethylovorans hollandica DSM 15978

Total Repeats: 39863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019977	AGG	2	6	705	710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435850243
2	NC_019977	GCT	2	6	854	859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435850243
3	NC_019977	AG	3	6	875	880	50 %	0 %	50 %	0 %	435850243
4	NC_019977	AAC	2	6	897	902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435850243
5	NC_019977	AGTGT	2	10	912	921	20 %	40 %	40 %	0 %	435850243
6	NC_019977	TTGC	2	8	962	969	0 %	50 %	25 %	25 %	435850243
7	NC_019977	A	6	6	1060	1065	100 %	0 %	0 %	0 %	435850243
8	NC_019977	TTG	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435850243
9	NC_019977	TGA	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850243
10	NC_019977	GAT	2	6	1118	1123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850243
11	NC_019977	CT	3	6	1237	1242	0 %	50 %	0 %	50 %	435850243
12	NC_019977	GAA	3	9	1247	1255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850243
13	NC_019977	ATG	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850243
14	NC_019977	CAGAT	2	10	1278	1287	40 %	20 %	20 %	20 %	435850243
15	NC_019977	GAA	2	6	1340	1345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850243
16	NC_019977	AGT	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850243
17	NC_019977	TCAA	2	8	1540	1547	50 %	25 %	0 %	25 %	435850243
18	NC_019977	AAC	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435850243
19	NC_019977	TTG	2	6	1725	1730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435850243
20	NC_019977	GAA	2	6	1749	1754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850243
21	NC_019977	ATG	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850243
22	NC_019977	TA	3	6	1928	1933	50 %	50 %	0 %	0 %	435850244
23	NC_019977	CTT	2	6	1969	1974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435850244
24	NC_019977	CTG	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435850244
25	NC_019977	AT	3	6	2012	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	435850244
26	NC_019977	CAT	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850244
27	NC_019977	CCT	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435850244
28	NC_019977	TATAA	2	10	2163	2172	60 %	40 %	0 %	0 %	435850244
29	NC_019977	CAT	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850244
30	NC_019977	TTA	2	6	2224	2229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850244
31	NC_019977	TTCT	2	8	2236	2243	0 %	75 %	0 %	25 %	435850244
32	NC_019977	TAC	2	6	2290	2295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850244
33	NC_019977	TTG	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435850244
34	NC_019977	CCTT	2	8	2439	2446	0 %	50 %	0 %	50 %	435850244
35	NC_019977	ATA	2	6	2488	2493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435850244
36	NC_019977	TCC	2	6	2497	2502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435850244
37	NC_019977	TA	3	6	2516	2521	50 %	50 %	0 %	0 %	435850244
38	NC_019977	ACA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435850244
39	NC_019977	AGA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850245
40	NC_019977	TGT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435850245
41	NC_019977	TCT	2	6	2716	2721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435850245
42	NC_019977	TAG	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850245
43	NC_019977	A	8	8	2808	2815	100 %	0 %	0 %	0 %	435850245
44	NC_019977	AGC	2	6	2849	2854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435850245
45	NC_019977	ATT	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850245
46	NC_019977	AT	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	435850245
47	NC_019977	TAA	2	6	3073	3078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435850245
48	NC_019977	A	6	6	3077	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	435850245
49	NC_019977	GTC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435850245
50	NC_019977	ATGA	2	8	3113	3120	50 %	25 %	25 %	0 %	435850245
51	NC_019977	CAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850245
52	NC_019977	TAC	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850245
53	NC_019977	GAAA	2	8	3365	3372	75 %	0 %	25 %	0 %	435850245
54	NC_019977	GTAG	2	8	3413	3420	25 %	25 %	50 %	0 %	435850245
55	NC_019977	AGA	3	9	3433	3441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850245
56	NC_019977	TTG	2	6	3522	3527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435850245
57	NC_019977	A	7	7	3611	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	435850245
58	NC_019977	ATG	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850245
59	NC_019977	TGC	2	6	3711	3716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435850245
60	NC_019977	TAT	2	6	3750	3755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850245
61	NC_019977	TGT	2	6	3772	3777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435850245
62	NC_019977	AT	3	6	3803	3808	50 %	50 %	0 %	0 %	435850245
63	NC_019977	TGG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435850245
64	NC_019977	ATG	2	6	3887	3892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850245
65	NC_019977	AGA	2	6	3896	3901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850245
66	NC_019977	TTA	2	6	3963	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850245
67	NC_019977	CA	3	6	4004	4009	50 %	0 %	0 %	50 %	435850245
68	NC_019977	TAG	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850245
69	NC_019977	ATGT	2	8	4441	4448	25 %	50 %	25 %	0 %	435850246
70	NC_019977	GATA	2	8	4491	4498	50 %	25 %	25 %	0 %	435850246
71	NC_019977	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850246
72	NC_019977	A	6	6	4768	4773	100 %	0 %	0 %	0 %	435850246
73	NC_019977	TAG	2	6	4862	4867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850246
74	NC_019977	CCT	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435850246
75	NC_019977	ATG	3	9	4912	4920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850246
76	NC_019977	GA	3	6	5000	5005	50 %	0 %	50 %	0 %	435850246
77	NC_019977	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850246
78	NC_019977	GGC	2	6	5120	5125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435850246
79	NC_019977	GAG	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435850246
80	NC_019977	TCT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435850246
81	NC_019977	AAGG	2	8	5266	5273	50 %	0 %	50 %	0 %	435850246
82	NC_019977	GAA	2	6	5353	5358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850246
83	NC_019977	GCT	2	6	5386	5391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435850246
84	NC_019977	TG	3	6	5591	5596	0 %	50 %	50 %	0 %	435850246
85	NC_019977	ATC	2	6	5630	5635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850246
86	NC_019977	ATG	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850246
87	NC_019977	AT	3	6	5668	5673	50 %	50 %	0 %	0 %	435850246
88	NC_019977	TA	3	6	5738	5743	50 %	50 %	0 %	0 %	435850246
89	NC_019977	TGA	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850246
90	NC_019977	ATC	2	6	5854	5859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850246
91	NC_019977	CAGC	2	8	5970	5977	25 %	0 %	25 %	50 %	435850246
92	NC_019977	AACA	2	8	6023	6030	75 %	0 %	0 %	25 %	435850246
93	NC_019977	CAT	2	6	6172	6177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850247
94	NC_019977	CTT	2	6	6206	6211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435850247
95	NC_019977	GAT	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850247
96	NC_019977	TC	3	6	6285	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	435850247
97	NC_019977	ATT	2	6	6326	6331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850247
98	NC_019977	AGT	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850247
99	NC_019977	ATT	2	6	6369	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850248
100	NC_019977	A	7	7	6376	6382	100 %	0 %	0 %	0 %	435850248
101	NC_019977	GAA	2	6	6402	6407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850248
102	NC_019977	AAG	2	6	6448	6453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850248
103	NC_019977	TTC	2	6	6461	6466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435850248
104	NC_019977	GCT	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435850248
105	NC_019977	AGA	2	6	6513	6518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850248
106	NC_019977	GAA	2	6	6526	6531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850248
107	NC_019977	TC	3	6	6652	6657	0 %	50 %	0 %	50 %	435850248
108	NC_019977	GAT	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850248
109	NC_019977	TTTGT	2	10	6756	6765	0 %	80 %	20 %	0 %	435850248
110	NC_019977	AG	3	6	6832	6837	50 %	0 %	50 %	0 %	435850248
111	NC_019977	CAT	2	6	6938	6943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850248
112	NC_019977	CAGA	2	8	7002	7009	50 %	0 %	25 %	25 %	435850248
113	NC_019977	TGC	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435850248
114	NC_019977	GAAA	2	8	7112	7119	75 %	0 %	25 %	0 %	435850248
115	NC_019977	CCA	2	6	7254	7259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435850249
116	NC_019977	GCAA	2	8	7310	7317	50 %	0 %	25 %	25 %	435850249
117	NC_019977	TGA	2	6	7356	7361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850249
118	NC_019977	CAC	2	6	7482	7487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435850249
119	NC_019977	TAC	2	6	7591	7596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850249
120	NC_019977	ATA	2	6	7649	7654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435850249
121	NC_019977	CCA	2	6	7677	7682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435850249
122	NC_019977	TCT	2	6	7683	7688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435850249
123	NC_019977	TCA	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850249
124	NC_019977	ATG	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435850249
125	NC_019977	TCA	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435850249
126	NC_019977	TGT	2	6	7967	7972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435850249
127	NC_019977	GAA	2	6	8002	8007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435850249
128	NC_019977	CAG	2	6	8016	8021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435850249
129	NC_019977	CTTT	2	8	8222	8229	0 %	75 %	0 %	25 %	435850249
130	NC_019977	ATT	2	6	8445	8450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850250
131	NC_019977	CAC	2	6	8583	8588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435850250
132	NC_019977	AC	3	6	8587	8592	50 %	0 %	0 %	50 %	435850250
133	NC_019977	CAA	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435850250
134	NC_019977	CTT	2	6	8640	8645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435850250
135	NC_019977	GTG	2	6	8672	8677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435850250
136	NC_019977	AAT	2	6	8694	8699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435850250
137	NC_019977	CATG	2	8	8721	8728	25 %	25 %	25 %	25 %	435850250
138	NC_019977	GTGAG	2	10	8861	8870	20 %	20 %	60 %	0 %	435850250
139	NC_019977	T	7	7	8892	8898	0 %	100 %	0 %	0 %	435850250
140	NC_019977	TAT	2	6	9021	9026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850251
141	NC_019977	TCCT	2	8	9198	9205	0 %	50 %	0 %	50 %	435850251
142	NC_019977	CTG	3	9	9212	9220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435850251
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144	NC_019977	TA	3	6	9280	9285	50 %	50 %	0 %	0 %	435850252
145	NC_019977	CA	3	6	9290	9295	50 %	0 %	0 %	50 %	435850252
146	NC_019977	TACA	2	8	9335	9342	50 %	25 %	0 %	25 %	435850252
147	NC_019977	GAG	2	6	9350	9355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435850252
148	NC_019977	GGT	2	6	9357	9362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435850252
149	NC_019977	TAT	2	6	9380	9385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850252
150	NC_019977	TGT	2	6	9394	9399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435850252
151	NC_019977	CAG	2	6	9425	9430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435850252
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157	NC_019977	ATT	3	9	9684	9692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	435850253
158	NC_019977	AGTAA	2	10	9704	9713	60 %	20 %	20 %	0 %	435850253
159	NC_019977	GT	3	6	9919	9924	0 %	50 %	50 %	0 %	435850253
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173	NC_019977	TTC	2	6	10892	10897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435850253
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262	NC_019977	AAT	2	6	16546	16551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435850259
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